En Mayo de 2003, UNION FENOSA comenzó un programa para mejorar sus sistemas de gestión medioambientales como la integración de los sistemas de calidad y medioambiente o la unificación de los sistemas de todas las centrales térmicas. El proyecto que ha culminado con la incorporación a EMAS.

UNION FENOSA Generación inició la certificación medioambiental de sus instalaciones en 1997 cuando AENOR constató que el sistema de gestión medioambiental de la central térmica de Meirama era conforme a la norma internacional ISO 14001 y la legislación medioambiental. En 2001 toda la potencia instalada de UNION FENOSA Generación estaba certificada conforme a ISO 14001 convirtiéndose de esta forma en la primera empresa española en alcanzar este reconocimiento por un tercero independiente. Fue pionera en la certificación de centrales hidráulicas y parques eólicos para lo cual desarrolló herramientas específicas (UMAS, Nor-MA, etc.) que han logrado que se alcancen los niveles actuales de excelencia ambiental.

El sistema EMAS se puso en marcha en abril de 1995 y fue revisado en 2001. Está destinado a mejorar el medio ambiente y proporciona a las organizaciones, los reguladores y el público un instrumento para evaluar y gestionar el impacto medioambiental de una organización. La norma que rige Emas es más exigente que la internacional ISO 14001 porque el grado de compromiso que la organización adquiere con las partes interesadas es mayor. Este compromiso se materializa mediante la Declaración Medioambiental que con una periodicidad anual es publicada por las instalaciones verificadas. La Declaración es sometida a una exhaustiva verificación por parte de un organismo externo acreditado para, en caso de ser correcta, quedar a disposición del público. Las Declaraciones Ambientales de las centrales adheridas a EMAS se encuentran en la página web de UNION FENOSA.